早在六十年代，在茅以升院长的积极倡导和主持下，我院就开始少量招收研究生。1978年成为全国首批恢复研究生招生与培养的单位之一，至2011年底，已招收培养学术型博、硕士研究生1160多名。现在读学术型博、硕士研究生181名，工程硕士研究生99名。目前，我院研究生教育拥有2个博士后科研流动站、4个与企业合作的博士后工作站，是“交通运输工程”一级学科博士学位授权单位，并有3个一级学科硕士学位授权点、6个二级学科博士学位点、14个二级学科硕士学位点和5个领域的工程硕士专业学位授权点。研究生能结合重大、前沿性的科研课题开展论文研究，宜于造就较强的实践和创新能力是中国铁道科学研究院研究生培养的一大特色。

学术型博士研究生招生专业6个：岩土工程、桥梁与隧道工程、道路与铁道工程、交通信息工程及控制、载运工具运用工程、交通运输规化与管理。

学术型硕士研究生招生专业14个：材料学、材料加工工程、电力系统及其自动化、计算机应用技术、岩土工程、桥梁与隧道工程、道路与铁道工程、交通信息工程及控制、载运工具运用工程、交通运输规划与管理、机械设计及理论、工程咨询、工程监理、铁路环境工程。

专业学位（工程硕士）硕士研究生招生专业领域5个：材料工程、电气工程、计算机技术、建筑与土木工程、交通运输工程。

1、我院研究生按国家规定发放助学津贴。此外，我院还建立了研实员津贴制度，在读研究生在参加导师课题项目期间，可获得相应的津贴补助。

2、我院为在读研究生提供了居住较为舒适的研究生公寓，硕士生3人/间、博士生2人/间。